Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MYH10-201ENST00000269243 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ANKRD55-201ENST00000341048 2502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 GTF2H2B-204ENST00000513202 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF431-207ENST00000600692 1971 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 C10orf126-202ENST00000614533 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LPXN-201ENST00000395074 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PAX6-273ENST00000640610 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AP000446.1-201ENST00000530045 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CIART-202ENST00000369094 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LILRB1-205ENST00000396331 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL139095.2-201ENST00000407940 730 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC093582.1-201ENST00000447086 385 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LINC02248-202ENST00000451579 606 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SL120P-201ENST00000463924 296 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RFKP2-201ENST00000464555 477 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NBR2-203ENST00000467245 1158 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DLEU1-220ENST00000478860 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 IGKV1-12-201ENST00000480492 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 IGKV1-17-201ENST00000490686 378 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC073861.1-201ENST00000496294 459 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AARSP1-201ENST00000514795 453 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC137055.1-201ENST00000549333 395 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC104758.5-201ENST00000569892 571 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ARL17A-204ENST00000570550 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ARL17B-204ENST00000571246 491 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RN7SL783P-201ENST00000577950 301 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC009303.2-209ENST00000588733 853 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ELOCP33-201ENST00000603716 632 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AP006545.2-201ENST00000607091 461 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 GPHN-201ENST00000315266 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 NLRC5-217ENST00000539144 6505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 MIA3-202ENST00000344507 2026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SAYSD1-202ENST00000373249 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ARL6-202ENST00000394206 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZFP30-202ENST00000392144 3916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF726-201ENST00000322487 2330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BZW2-201ENST00000258761 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 EBF2-201ENST00000408929 1888 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CCNJL-208ENST00000541762 2965 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC010643.1-201ENST00000599433 3263 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SUN1-203ENST00000401592 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PLCD4-203ENST00000432688 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 KCNK2-202ENST00000391895 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 IL1A-201ENST00000263339 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF280A-201ENST00000302097 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PKD1L2-203ENST00000525539 7379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TACC2-229ENST00000515603 9101 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DHX8-201ENST00000262415 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ARHGEF34P-201ENST00000483587 4532 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LTBP1-204ENST00000407925 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC091304.1-201ENST00000564897 3034 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ZNF709-201ENST00000397732 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC007614.6-201ENST00000623729 2620 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 CHCHD5-202ENST00000409719 3272 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RHAG-202ENST00000371175 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SNORA42.2-201ENST00000384771 134 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DYNC2LI1-204ENST00000406852 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AL590133.1-201ENST00000412838 368 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SAA2-202ENST00000414546 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AP000844.2-201ENST00000419440 509 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 LINC01006-203ENST00000425712 661 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 PDCL3P6-201ENST00000429744 706 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC093166.1-201ENST00000442243 330 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC092042.3-203ENST00000443313 950 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AP001885.1-202ENST00000444002 1255 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC064862.2-201ENST00000445460 196 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 COX5BP6-201ENST00000454311 211 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 DMKN-237ENST00000472252 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 RPL7AP9-201ENST00000484287 800 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SYNPR-AS1-201ENST00000488201 558 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TPM3P9-202ENST00000492121 745 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 ARHGAP22-IT1-201ENST00000505718 470 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 BTNL8-207ENST00000511704 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC010343.3-201ENST00000512323 446 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 TDGF1P5-201ENST00000523009 453 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC124276.2-201ENST00000527997 550 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 SAA1-203ENST00000532858 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC005186.1-201ENST00000534849 570 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LMO3Q8TAP4 AC008770.2-201ENST00000547473 542 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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