Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KLF2Q9Y5W3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLF2Q9Y5W3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms