Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RHBDD3Q9Y3P4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms