Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REXO2Q9Y3B8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REXO2Q9Y3B8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms