Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COQ4Q9Y3A0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COQ4Q9Y3A0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms