Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP3Q9Y2W1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THRAP3Q9Y2W1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms