Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YBX2Q9Y2T7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YBX2Q9Y2T7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms