Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B0

CNPY2, Protein canopy homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY2Q9Y2B0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNPY2Q9Y2B0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNPY2Q9Y2B0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms