Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUDCQ9Y266 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUDCQ9Y266 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms