Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS3Q9UPU3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms