Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGAP1Q9UPQ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms