Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TNFSF18Q9UNG2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms