Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN88

GABRQ, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRQQ9UN88 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRQQ9UN88 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRQQ9UN88 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRQQ9UN88 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABRQQ9UN88 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABRQQ9UN88 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms