Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PTPRQQ9UMZ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPRQQ9UMZ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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