Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP18Q9UMW8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
USP18Q9UMW8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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