Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SYNPO2Q9UMS6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SYNPO2Q9UMS6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SYNPO2Q9UMS6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms