Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPCN1Q9ULQ1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPCN1Q9ULQ1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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