Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRXN1Q9ULB1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRXN1Q9ULB1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
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