Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PACSIN3Q9UKS6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PACSIN3Q9UKS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms