Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP4Q9UKK3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP4Q9UKK3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms