Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms