Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTH4Q9UIA0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms