Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2IRD1Q9UHL9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms