Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SWAP70Q9UH65 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWAP70Q9UH65 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms