Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DUX4Q9UBX2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DUX4Q9UBX2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms