Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EXTL2Q9UBQ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EXTL2Q9UBQ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms