Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTN3Q9P232 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTN3Q9P232 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms