Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COL20A1Q9P218 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms