Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
EHD3Q9NZN3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
EHD3Q9NZN3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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