Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PODXL2Q9NZ53 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms