Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BARHL2Q9NY43 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BARHL2Q9NY43 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms