Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TOR4AQ9NXH8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms