Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERVK13-1Q9NX77 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms