Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RHBDL2Q9NX52 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHBDL2Q9NX52 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms