Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C1orf109Q9NX04 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C1orf109Q9NX04 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms