Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NLE1Q9NVX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLE1Q9NVX2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms