Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MED17Q9NVC6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MED17Q9NVC6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms