Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC39A9Q9NUM3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC39A9Q9NUM3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms