Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FOXD4L1Q9NU39 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXD4L1Q9NU39 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms