Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A13Q9NSD5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A13Q9NSD5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A13Q9NSD5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms