Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LTBP3Q9NS15 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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