Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TULP4Q9NRJ4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TULP4Q9NRJ4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms