Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GDF3Q9NR23 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GDF3Q9NR23 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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