Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C8orf4Q9NR00 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C8orf4Q9NR00 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms