Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EXOSC3Q9NQT5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms