Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PCDH12Q9NPG4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms