Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBX8Q9HC52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBX8Q9HC52 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms