Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNCQ9H7C4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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