Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PARLQ9H300 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms