Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LHX5Q9H2C1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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